¡La guerra entre el reino de la ciencia y el reino de la petrificación termina siendo un duelo entre Senku e Ibara! ¿Podrá Senku obtener el arma petrificadora para que el sacrificio de sus compañeros no haya sido inútil? ¡Una revelación sobre la voz de Whyman llevará al reino de la ciencia a ir hacia una nueva aventura!
Senku empieza a revivir a cada uno a sus compañeros del reino de la ciencia y juntos preparan una estrategia para robar Medusa, el arma petrificadora. Después de reunir todo el material científico necesario para su plan, se dirigen al campo de batalla. Ahí se cambian los planes y Senku se ve obligado a liberar a Hyoga para que los ayude. Mientras tanto, Ibara decide que va a cubrir toda la isla con el rayo petrificador.
Después de haber completado la máquina de poción despetrificadora infinita, el reino de la ciencia se prepara para enfrentarse al reino de la petrificación con un dron. Para su construcción, empiezan resucitando a Kaseki, y luego a todos los demás. Mientras tanto, Ginro realiza una primera toma de contacto con el patriarca, pero en su misión resulta herido de gravedad y termina siendo petrificado junto a Kohaku. Por otro lado, Moz encuentra el escondite del reino de la ciencia y tiene lugar una difícil negociación.
Senku y los suyos logran engañar a algunos de los hombres más fuertes de la isla y recuperar el laboratorio móvil que hay en el barco. Gracias a él transforman a Kohaku y Ginro en Bellezas que puedan ser seleccionadas para entrar en el harén de la isla junto a Amarayllis. Una vez infiltrada en la base enemiga, Kohaku descubre la ubicación ¡del cofre del tesoro!
A pesar de las dificultades y gracias al liderazgo de Senku y Ryusui, ¡el reino de la ciencia logra construir un velero motorizado! Senku y unos pocos elegidos se embarcan en una aventura para descubrir el misterio de la petrificación y salvar a toda la humanidad. Su primer destino es una isla del tesoro que esconde un objeto clave para esa gran misión. En cuanto llegan, descubren que el patriarca, la máxima autoridad de la isla, tiene el poder de convertir a la gente en piedra.
Gracias a la exploración realizada desde el globo aerostático, Senku y los suyos logran elaborar un mapa, que utilizan para combatir la escasez de alimentos. Resucitan a François, el mayordomo y chef particular de Nanami, para que les prepare el pan revolucionario que necesitan para el viaje. Por otro lado, durante una expedición de prueba con una pequeña lancha motorizada, ¡se produce un encuentro inesperado! Alguien les envía un mensaje en código morse con la palabra "why" repetidas veces, y la respuesta de Senku es desafiante.
Después de ideárselas para criopreservar el cuerpo de Tsukasa, quien recibe una herida mortal en el combate contra Hyoga, Senku diseña un barco e inicia sus planes de viajar al otro lado del mundo. Logra encontrar un capitán, pero le falta el combustible, así que... ¡el reino de la ciencia se dispone a surcar los cielos para encontrar un yacimiento de petróleo!
Chrome logra escapar por su cuenta y se reúne con sus compañeros. Senku se reencuentra con Taiju y Yuzuriha después de un año sin verse, pero no tiene tiempo que perder y lanza un ataque sorpresa con el objetivo de recuperar la cueva milagrosa. ¡La batalla final entre el reino de la ciencia y el imperio de Tsukasa comenzó!
Después de librarse de la vigilancia de Homura, Chrome, Gen y Magma se infiltran sin problemas en la base del enemigo. Ahí terminan con éxito su misión de esconder el celular, pero tienen que enfrentarse a Ukyô y solo Gen y Magma pueden escapar.
Taiju y Yuzuriha también logran llevar a cabo su misión: reclutar a uno de los hombres de Tsukasa. Mientras tanto, el reino de la ciencia fabrica un automóvil para rescatar a Chrome, preso en el imperio de Tsukasa.
Senku, Chrome y Magma realizan una expedición en busca de minerales raros para la fabricación de los teléfonos celulares. Después de mucho esfuerzo y gracias a la colaboración de todos los habitantes de la aldea, ¡consiguen fabricar dos unidades! Ahora solo falta hacerles llegar uno de los teléfonos a Taiju y Yuzuriha, quienes se encuentran infiltrados en el imperio de Tsukasa
Byakuya, el padre de Senku, volvió a la tierra después de que toda la humanidad se convirtiera en piedra. ¿Cual es el legado que le dejo a Senku miles de años atrás?.
La aldea Ishigami es atacada por Tsukasa, para defenderse Senku encontrará la solución, las espadas más poderosas: "las hojas de la ciencia".
Después de crear electricidad con éxito, Senku y sus nuevos compañeros empiezan a seguir su hoja de ruta, trazada con el objetivo de elaborar un remedio universal a base de sulfamida. Para ello, se dirigen a una zona muy peligrosa en busca del ingrediente más difícil de obtener, el ácido sulfúrico, pero no van a poder extraerlo sin antes haber diseñado unas máscaras de gas. Poco después, en la aldea está a punto de celebrarse un torneo de artes marciales en el que el cargo de jefe y la mano de la sacerdotisa están en juego.
Después de crear electricidad con éxito, Senku y sus nuevos compañeros empiezan a seguir su hoja de ruta, trazada con el objetivo de elaborar un remedio universal a base de sulfamida. Para ello, se dirigen a una zona muy peligrosa en busca del ingrediente más difícil de obtener, el ácido sulfúrico, pero no van a poder extraerlo sin antes haber diseñado unas máscaras de gas. Poco después, en la aldea está a punto de celebrarse un torneo de artes marciales en el que el cargo de jefe y la mano de la sacerdotisa están en juego.
Senku llega a la aldea de Kohaku, donde intenta reclutar más aliados. Tras su encuentro con Kinro y Ginro y dejarlos impresionados con sus “hechizos” se bate en un duelo de ciencia con Chrome, del que sale victorioso. Entonces, ambos deciden colaborar para crear una remedio que cure la enfermedad de la hermana de Kohaku, la sacerdotisa de la aldea. ¡El gran desafío de levantar el reino de la ciencia dio comienzo!
La humanidad se convierte en piedra en un abrir y cerrar de ojos. Taiju Oki, un alumno de bachillerato grande y fuerte, y su amigo Senku, un científico de mente ilustre, reviven y se marcan como objetivo construir una civilización desde cero. Tras revivir a Yuzuriha, nuestros protagonistas se ponen manos a la obra para detener la masacre de Tsukasa y deciden dirigirse a Hakone con el objetivo de producir pólvora para combatir. Una vez allí, avistan señales de humo a lo lejos y Senku decide correr el riesgo de responder.