Los Ojos Cruzados usan humo de Chota en un intento de regresar a Aikawa a la normalidad, pero él se fusiona con una gran cantidad de cabezas cercenadas y se convierte en una especie de monstruo. Mientras tanto, los sobrevivientes de la familia de En escapan de su escondite debido a la lluvia de Hole y, por su parte, Nikaido, Asu y Risu también regresan a dicha ciudad. Risu decide buscar a su asesino a como dé lugar.
Nikaido decide usar su magia para regresar al pasado junto con Risu a fin de averiguar más cosas sobre el origen de Caimán. Mientras tanto, su conversión en demonio continúa avanzando. Por otro lado, la familia de En establece su nueva base secreta en el hospital del doctor Vaux. Gracias a que sigue siendo invisible, Fujita averigua algunos datos sobre los Ojos Cruzados; además, consigue llegar a la criatura que alberga el tumor demoniaco de En.
Risu y los demás van a la Tienda Departamental Central de Hole con intención de vender gyoza, pero enfrentan algunos embrollos a causa de la transformación demoniaca de Nikaido. Por casualidad, la familia de En se dirige al mismo establecimiento con intención de comprar ingredientes para elaborar una figura de Fujita. Por su parte, el joven hechicero observa cómo el jefe de los Ojos Cruzados aniquila a sus subordinados y Tetsujo se rebela contra él.
Frases
Nosotros no le importamos. ¡Es un monstruo comehechiceros! —Tetsujo
Yo también tengo que escapar rápido… ¡pero no sin llevarme el tumor del señor En! —Fujita
¡Coman cuanto quieran! ¡Son los bento de gyoza de Hungry Bug! —Nikaido
Ai/Aikawa finalmente revela la verdad acerca del surgimiento de la “cosa” que fue el jefe de los ojos cruzados y su motivación para actuar. En decide encargarse de aniquilar a tan terrible amenaza y usa todo el poder de su magia en un combate definitivo contra ella… Pero ¿realmente puede vencer? Parece que todo marcha de acuerdo con el plan de Chidaruma, quien manipula los acontecimientos para que “algo” nazca. ¿De qué se trata y cuáles serán las consecuencias?
Finalmente llega el momento que Chidaruma esperaba: el nacimiento de Hole, un ser titánico que tiene como objetivo la aniquilación de todos los hechiceros. Solo Caimán, Asu y Nikaido se interponen en su camino; así da inicio una cruenta batalla durante la cual Nikaido agota el uso de su magia de tiempo. La última esperanza recae en Caimán, quien decide hacer un trato con los hechiceros sobrevivientes para obtener más poder, pero ignora algo esencial al respecto…
Caimán está dispuesto a todo para revivir a Nikaido y a Asu, así que hace lo impensable a fin de derrotar a Hole: ¡usa sus nuevos poderes de hechicero! Y estos se manifiestan en forma de… ¡¿un cetro viviente de gyoza?! Pero su magia es genial, pues es tanto ofensiva como defensiva y curativa. Por otro lado, la familia de En está en problemas, pero encuentra una última esperanza en la cabeza de Sho. ¡Averigua cómo concluye esta desenfrenada historia de Q Hayashida!
Finalmente llega el momento que Chidaruma esperaba: el nacimiento de Hole, un ser titánico que tiene como objetivo la aniquilación de todos los hechiceros. Solo Caimán, Asu y Nikaido se interponen en su camino; así da inicio una cruenta batalla durante la cual Nikaido agota el uso de su magia de tiempo. La última esperanza recae en Caimán, quien decide hacer un trato con los hechiceros sobrevivientes para obtener más poder, pero ignora algo esencial al respecto…
El día que Taiju Oki, un alumno de bachillerato grande y fuerte pero algo torpe, decide declararle su amor a Yuzuriha, sucede un fenómeno inesperado: toda la humanidad se convierte en piedra en un abrir y cerrar de ojos. Miles de años más tarde, Taiju vuelve a la normalidad y se entera de que su amigo Senkû, un científico de mente ilustre, también ha sobrevivido. Juntos encuentran una fórmula para volver a la vida a las estatuas que siguen intactas y se ponen como objetivo construir una civilización desde cero.
La humanidad se convierte en piedra en un abrir y cerrar de ojos. Taiju Oki, un alumno de bachillerato grande y fuerte, y su amigo Senku, un científico de mente ilustre, reviven y se marcan como objetivo construir una civilización desde cero. Tras revivir a Yuzuriha, nuestros protagonistas se ponen manos a la obra para detener la masacre de Tsukasa y deciden dirigirse a Hakone con el objetivo de producir pólvora para combatir. Una vez allí, avistan señales de humo a lo lejos y Senku decide correr el riesgo de responder.
Senku llega a la aldea de Kohaku, donde intenta reclutar más aliados. Tras su encuentro con Kinro y Ginro y dejarlos impresionados con sus “hechizos” se bate en un duelo de ciencia con Chrome, del que sale victorioso. Entonces, ambos deciden colaborar para crear una remedio que cure la enfermedad de la hermana de Kohaku, la sacerdotisa de la aldea. ¡El gran desafío de levantar el reino de la ciencia dio comienzo!
Después de crear electricidad con éxito, Senku y sus nuevos compañeros empiezan a seguir su hoja de ruta, trazada con el objetivo de elaborar un remedio universal a base de sulfamida. Para ello, se dirigen a una zona muy peligrosa en busca del ingrediente más difícil de obtener, el ácido sulfúrico, pero no van a poder extraerlo sin antes haber diseñado unas máscaras de gas. Poco después, en la aldea está a punto de celebrarse un torneo de artes marciales en el que el cargo de jefe y la mano de la sacerdotisa están en juego.
Senku, Chrome y Magma realizan una expedición en busca de minerales raros para la fabricación de los teléfonos celulares. Después de mucho esfuerzo y gracias a la colaboración de todos los habitantes de la aldea, ¡consiguen fabricar dos unidades! Ahora solo falta hacerles llegar uno de los teléfonos a Taiju y Yuzuriha, quienes se encuentran infiltrados en el imperio de Tsukasa
Después de librarse de la vigilancia de Homura, Chrome, Gen y Magma se infiltran sin problemas en la base del enemigo. Ahí terminan con éxito su misión de esconder el celular, pero tienen que enfrentarse a Ukyô y solo Gen y Magma pueden escapar.
Taiju y Yuzuriha también logran llevar a cabo su misión: reclutar a uno de los hombres de Tsukasa. Mientras tanto, el reino de la ciencia fabrica un automóvil para rescatar a Chrome, preso en el imperio de Tsukasa.
Chrome logra escapar por su cuenta y se reúne con sus compañeros. Senku se reencuentra con Taiju y Yuzuriha después de un año sin verse, pero no tiene tiempo que perder y lanza un ataque sorpresa con el objetivo de recuperar la cueva milagrosa. ¡La batalla final entre el reino de la ciencia y el imperio de Tsukasa comenzó!
Gracias a la exploración realizada desde el globo aerostático, Senku y los suyos logran elaborar un mapa, que utilizan para combatir la escasez de alimentos. Resucitan a François, el mayordomo y chef particular de Nanami, para que les prepare el pan revolucionario que necesitan para el viaje. Por otro lado, durante una expedición de prueba con una pequeña lancha motorizada, ¡se produce un encuentro inesperado! Alguien les envía un mensaje en código morse con la palabra "why" repetidas veces, y la respuesta de Senku es desafiante.
A pesar de las dificultades y gracias al liderazgo de Senku y Ryusui, ¡el reino de la ciencia logra construir un velero motorizado! Senku y unos pocos elegidos se embarcan en una aventura para descubrir el misterio de la petrificación y salvar a toda la humanidad. Su primer destino es una isla del tesoro que esconde un objeto clave para esa gran misión. En cuanto llegan, descubren que el patriarca, la máxima autoridad de la isla, tiene el poder de convertir a la gente en piedra.